この問題を解決することができました。
data/submarine/各種U-ボートのフォルダのcfgの中にstorm conditionsに関する:
StormConditions=99,1;max wind speed [m/s], max rain intensity [0,1](これは嵐の中でも艦載砲を撃てるように修正してありますが)のところで1を0.1に変えることにより見事 クルーは雨合羽を着てくれるようになりましたがその代わり嵐の中での艦載砲の使用はできません でした。
どなたか雨合羽を着た状態で艦載砲を撃てる方法があれば教えてください。