Ese es un bug del SH3, al vigía hay que sacarlo de la cama por las orejas y llevarlo a la vela cada vez que sales a superficie.
Pero con el parche de H.sie se solucionó ese tema y muchos otros, así como se agregaron muchas mejoras al ejecutable del SH3. Te aconsejo darte una vuelta por este link:
http://www.subsim.com/radioroom/showthread.php?t=212462
Saludos!